《终极悬案》剧情紧凑且扣人心弦。故事发生在千禧年初夏的厦海市，一个月黑风高的深夜，年轻美丽的女内衣模特程萌萌被发现生死不明地躺在一座豪宅的客厅里。警方介入调查后，吃惊地发现程萌萌已身怀六甲，且她的身份证是假的，真实身份成谜。

随着调查的深入，警方发现与程萌萌有千丝万缕关系的男人众多，包括香港纤娇制衣公司总经理钱昌富、以偷窃为生的马小三、澳门黑社会人物鲁子濠、海关报关处处长陶钧、精神病患者王小军以及快餐店老板胡奔。他们虽然身份各异，但都具备杀害程萌萌的动机和时机。

然而，剧情的发展远不止于此，随着更多线索的浮现，数个惊人的秘密逐一揭晓。警方在追踪真相的过程中，不仅揭示了程萌萌的真实身份，还逐渐揭开了现代都市人复杂的生存状态和心理隐私。整个故事充满了悬疑与推理，每一集都让人欲罢不能，直到最后一刻才真相大白。